哪吒见天下大旱，不忍众生遭劫，前往水族兴师问最新电影。在东海寿宴上与东海龙王三太子敖丙大打出手，但妖族作梗，杀死敖丙后栽赃于哪吒。东海龙王前往陈塘关兴师问罪，哪吒由于不愿牵累父母，于当场自戕，以此谢罪。哪吒原为灵珠子，这一切都是他命中劫数，太乙真人将碧藕为骨，荷叶为衣，为哪吒重造仙躯，使之起死回生，然而代价有二，其一，哪吒需入凡尘，寻回五样随身法宝，其二则需帮助小龙女打败蛇姬、复兴水族，如此哪吒方能偿还所有罪愆，重回凡间，与家人团圆。后来哪吒发现昔日大旱与敖丙之死，均为蛇姬逆谋篡位的手段，蛇姬与妖族大帝联手，将四位龙王囚禁，使得龙宫易主，从此成了四海之王。就在一同寻找法宝、以及对抗蛇姬追杀的旅途中，小龙女与哪吒从原本不信任的敌对立场，逐渐建立了深厚的情感，两人携手合作，最后终于集齐了五项法宝，打败蛇姬与妖族大帝，复兴水族，伸张了正义。